Zaawansowane algorytmy w imię poprawy zdrowia publicznego (FILM)

Projekt polegał na implementacji technologii sekwencjonowania nowej generacji (next generation sequencing – NGS) do oceny subtypu, rekombinacji oraz oporności lekowej HIV-1. Technologia ma wspierać terapie antyretrowirusowe, w tym oporność na nowe, długodziałające preparaty iniekcyjne i przeciwciała monoklonalne.

Liczba zakażeń HIV w Polsce wzrasta, zmienia się cały kalejdoskop epidemiologiczny ze względu na migrację, ale też ze względu na transmisję pomiędzy obywatelami. Istotą tego projektu jest użycie w leczeniu nowej, bardzo precyzyjnej technologii, tak zwanego sekwencjonowania NGS nowej generacji. W kontekście zakażenia HIV projekt jest innowacyjnym rozwiązaniem i dotyka bardzo ważnego zjawiska epidemiologicznego. To jakby zajrzeć w głąb wirusa i zobaczyć jak on mutuje, jak rozwija wrażliwość na leki, jak zmienia się epidemiologiczne, jak przenosi się w klastrach - grupach transmisji. A wszystko po to, by poprawić skuteczność leczenia i zobaczyć, którym zakażeniom możemy najlepiej zapobiegać. To jest pierwszy w Polsce projekt, który wdraża nową technologię właśnie takiego precyzyjnego zaglądnięcia do wirusa.

- Wdrażamy tę nową technologię, która jest bardzo precyzyjna i może wykryć nawet bardzo niewielką ilość mutacji. Przekładamy ją na profilaktykę pacjenta i uczymy lekarzy, jak interpretować wyniki tak, by dobro pacjenta było jak najbardziej spełnione, by leki były optymalnie dobrane, by wirus był całkowicie wyhamowany i nie dochodziło do transmisji oraz do selekcji nowych oporności na leki. – mówi prof. Miłosz Parczewski, kierownik Kliniki Chorób Zakaźnych, Tropikalnych i Nabytych Niedoborów Immunologicznych - Leki antyretrowirusowe mogą w niektórych grupach wirusów powodować oporność i my tym projektem bardzo precyzyjnie i głęboko to oceniamy. Jesteśmy w stanie wskazać klinicyście leki, które zadziałają tak, żeby pacjent był jak najlepiej leczony, żeby przerwać łańcuchy transmisji i żeby pacjent żył jak najlepiej ze skutecznie leczonym zakażeniem HIV.

W zakresie projektu było opracowanie oraz wprowadzenie do praktyki klinicznej zaawansowanych algorytmów interpretacyjnych opartych na NGS i zawierających przejrzystą ocenę lekooporności. Ten system diagnostyczny doprowadzi do lepszego doboru terapii antyretrowirusowych, a nowa wiedza przyczyni się do poprawy zdrowia publicznego i efektywności systemu ochrony zdrowia, zgodnie z wytycznymi UE oraz krajowymi.

W badaniu wysekwencjonowano 1000 genomów u osób z populacji pacjentów już leczonych z wielolekoopornością (HTE ) oraz nieleczonych antyretrowirusowo, z uwzględnieniem migrantów z Ukrainy i innych krajów.

Projekt „Implementacja sekwencjonowania NGS genomu HIV-1 dla precyzyjnej oceny ryzyka rekombinacji i lekooporności u osób żyjących z HIV” nr KPOD.07.07-IW.07-0042/24   finansowany w ramach Krajowego Planu Odbudowy i Zwiększania Odporności, Komponent D Efektywność, dostępność i jakość systemu ochrony zdrowia, Inwestycja D3.1.1 Kompleksowy rozwój badań w zakresie nauk medycznych i nauk o zdrowiu.

Dofinansowanie: 4 577 968,50 zł.